Kalnišķis ir latviešu cilmes uzvārds, kas radies no vārda "kalns" ar izskaņu "-išķis", kas norāda uz cilvēku, kas saistīts ar kalniem vai kalnainu apvidu. Šāda veida uzvārdi bieži cēlušies no dzīvesvietas, nodarbošanās vai īpašībām. Latvijā tas ir retāk sastopams uzvārds.
Slaveni cilvēki ar uzvārdu Kalnišķis:
- Jānis Kalnišķis — latviešu futbolists, spēlējis aizsarga pozīcijā, pārstāvējis vairākus Latvijas klubus.
- Andris Kalnišķis — latviešu hokejists, spēlējis aizsarga pozīcijā, dalībnieks Latvijas hokeja līgā.
Uzvārds galvenokārt sastopams Latvijā un saistīts ar sporta jomu.