Pauniņa ir latviešu cilmes uzvārds, kas cēlies no vārda "pauna" — sieviešu dzimtes forma no "paunis" (pavs, tēviņš pīle). Tas norāda uz cilvēku, kas bijis saistīts ar pīļu audzēšanu vai tirdzniecību, vai arī radies kā iesauka.
Slaveni cilvēki ar šo uzvārdu:
1. Marija Pauniņa (1843—1910) — latviešu aktrise, režisore un teātra darbiniece.
2. Jānis Pauniņš (1865—1937) — latviešu ārsts un sabiedriskais darbinieks.
3. Voldemārs Pauniņš (1872—1954) — latviešu gleznotājs.
4. Ojārs Pauniņš (dzimis 1959. gadā) — latviešu politiķis, bijis Saeimas deputāts.
Uzvārds ir izplatīts Latvijā, un tā nesēji bieži saistīti ar kultūras, mākslas vai sabiedriskās dzīves jomām.