Uzvārds "Markune" ir reti sastopams, un tā precīza etimoloģija nav viennozīmīgi nosakāma. Visticamāk, tas cēlies no personvārda "Markus" (no latīņu "Marcus") ar piedēkli, kas norāda uz radniecību vai piederību, līdzīgi kā citos latviešu uzvārdos (piemēram, "Markovskis"). Varētu būt saistīts ar vēsturisku personu vārdu "Markuss" vai atvasināts no kādas vietvārda.
Slaveni cilvēki ar šo uzvārdu nav plaši pazīstami starptautiski vai Latvijas kontekstā. Uzvārds var būt sastopams retos gadījumos kā individuāls uzvārds, taču nav dokumentētu ievērojamu personību ar šo uzvārdu vēsturē, politikā, mākslā vai zinātnē. Iespējams, tas ir lokalizēts vai ģimenes vēsturisks uzvārds ar ierobežotu izplatību.