Uzvārds "Markuna" ir reti sastopams, un tā izcelsme nav viennozīmīgi nostiprināta. Visticamāk, tas ir saistīts ar vārdu "Markus" (no latīņu "Marcus"), kas varētu būt radies kā patronīms vai piederības forma, piemēram, nozīmējot "Marka dēls" vai "piederēt Markam". Reģionāli tas var būt saistīts ar Baltijas vai Slāvu apvidī, kur uzvārdi bieži veidojas no personvārdiem ar piedēkļiem "-una", "-iņš" u.c.
Slaveni cilvēki ar šo uzvārdu nav plaši pazīstami starptautiski, taču uzvārds "Markuna" vai tā līdzīgas formas atrodamas, piemēram:
- Māris Markuns — latviešu aktieris un režisors.
- Uzvārds "Markun" vai "Markuna" var būt sastopams arī kā rets uzvārds Austrumeiropā, piemēram, Horvātijā vai Slovēnijā.
Vēsturiski uzvārds varētu būt saistīts ar ģimenēm, kuru senči nesa vārdu "Markus" vai "Marks". Lingvistiski tas atspoguļo tipisku uzvārdu veidošanas modeli daudzās Eiropas kultūrās, kur no personvārda tiek veidota piederības forma.