Pekšens ir latviešu cilmes uzvārds, kas radies no personvārda "Pēteris" (vācu formā "Peter") ar izskaņu "-šens", kas raksturīga daudziem latviešu uzvārdiem. Tas var būt saistīts arī ar vācu ietekmi Baltijā.
Slaveni cilvēki ar šo uzvārdu:
1. Edgars Pekšens – pazīstams kā mūziķis un producents, viens no grupas "Carnival Youth" dibinātājiem.
2. Jānis Pekšens – latviešu futbolists, spēlējis vairākos Latvijas klubos.
Uzvārds vēsturiski sastopams galvenokārt Latvijā, un tā nesēji bieži ir saistīti ar kultūras vai sporta jomām.